プロファイル

なんとFirefoxの設定ファイルは"C:\Documents and Settings\$username\Application Data"に保存されるらしい。Cドライブはしょっちゅうクリーンインストールするし、設定はインストールフォルダの下に固めておいておきたいのでこれは困る。
Firefoxは「プロファイル」という単位で設定ファイル群を管理してるらしく、それは任意のフォルダに作れるらしい。

firefox -p

でプロファイルエディタが起動できるので、好きなように設定。手動で設定するときは、%APPDATA%/Mozilla/Firefox/profiles.iniを編集すればいいっぽい。
http://www.mozilla-japan.org/support/firefox/profile